L'Association Internationale de Sociologie est dirigée par l'Assemblé des Conseils composée de tous les membres du Conseil des Associations Nationales et du Conseil de Recherche.

Le Conseil des Associations Nationales est formé par un délégué de chaque pays membre. Le Conseil de Recherche est composé de tous les Comités de Recherche et supervise les activités scientifiques de l'AIS. Tous les quatre ans, pendant le Congrès Mondial de Sociologie, l'Assemblée des Conseils élit le Président et Vice-Présidents. Chaque Conseil élit 8 membres du Comité Exécutif, qui gérera les affaires de l'Association pendant la période entre les congrès. Le Secrétariat exécute les décisions et mène les affaires administratives.

Les membres du Comité Exécutif ont des fonctions dans au moins dans un des sous-comités suivants:

La Faculté de Sciences Politiques et Sociologie de l=Université Complutense de Madrid, Espagne, accueille le siège de l'AIS. Les activités de l'Associations sont financées au 90% par les cotisations des affiliés et la vente des publications, et au 10% par une subvention de l'Unesco/ISSC.